蔡邕还欲分辩，王允一声断喝：“够了！”朝中百官都是一抖，众人惊愕间，他急声骂道：“董卓猖狂，就是你这样的人太多！我每日出入幕府，见尔等借着董卓的威风登上高位，尸位素餐，不思报国，反而助纣为虐。竟到现在还不悔改，尔等莫非以为，吾之刀剑不如董卓之快？”
说罢，他当即呼唤宫中侍卫，下令将蔡邕关入诏狱。这一切发生得太快，剩下那些本来还想劝谏一番的大臣们，如今也不敢言语，就转而注视着蔡邕。蔡邕年岁已大，发髻已是半白，身体也较为虚弱，如今戴上镣铐，才走上几十步，整个人便显得疲累不堪，以至于跟随侍卫走下殿阶时，还需要侍卫搀扶，众人心中顿生一种悲怆之情，不少人都低头不忍再看。
趁此机会，王允又禀告天子，下令追责，将那些进入过董卓幕府，而又没有参与反董事宜的朝臣，一并革职问罪。而后又多拔擢被董卓罢黜的原袁氏掾吏，以表明自己对董卓旧党绝不姑息的态度。
当夜，太尉马日磾前往司徒府上，对王允劝说：“人非圣贤，孰能无过呢？司徒这样苛求同僚，只会让人人自危，人心沦丧，这又是何苦呢？即便如此，也不能在朝上直接逮捕蔡公啊！蔡公文坛领袖，士人仰慕，怎能如此处理？又有陈庭坚为亲，司徒