现新大陆，1497年达·伽马发现好望角，1519～1522年麦哲伦环绕世界一周。许多药物，如鸦片、樟脑、松香等，由东方传入欧洲，美洲发现后，欧洲也有了金鸡纳、愈创木、可可果。
由于资本主义的兴起，首先在意大利形成了资产阶级的知识分子。他们的特点是敢于向教会思想挑战，反对宗教迷信的束缚。他们的口号是：“我是人，人的一切我应该了解”，以此来反对神学的统治。他们一方面传播新文化，一方面竭力钻研和模仿古代希腊的文化，因此此时期称为“文艺复兴”。1543年哥白尼出版《天体运行论》，是科学史上文艺复兴的开始。
文艺复兴运动中，怀疑教条、反对权威之风兴起。于是，医界也产生了一场以帕拉切尔苏斯为代表的医学革命。中世纪的医学校，主要讲阿维森纳的《医典》，以及加伦和希波克拉底的著作。教师照本宣科，一切墨守成规，毫无生气。文艺复兴的狂潮，很快就波及医学领域。帕拉切尔苏斯指出人体的生命过程是化学过程。他在巴塞尔大学任教时主张用流行的德语写书和讲演，使医学易为大众所接受，这是一件伟大的改革。
医学发展在这个时期的主要表现，首先是人体解剖学的建立。古代的人认为身体是灵魂寄