亚氏虽然主张灵魂依存于躯体，却又把灵魂提到原因、本体、本质、形式、现实的高度。灵魂显然优于高于躯体。他指出：“灵魂在最首要的意义上乃是我们赖以生存、感觉和思维的东西，所以，灵魂是定义或形式，而非质料或基质。”
“灵魂是有生命躯体的原因和本原”。具体而言，灵魂是在三种意义上作为生命躯体的原因和本原：躯体运动的来源，躯体的目的，整个生命躯体的本质(本体)。首先，事物的本体(本质)就是事物存在的根据。对生命体而言，灵魂正是他们的存在和他们的生命的原因或本原。其次，灵魂也是目的意义上的原因，因为自然活动像理智一样，总是为着某一目的。灵魂合乎自然地为生物提供了这样的目的，所有自然躯体都是灵魂的工具(器官)，动物躯体和植物躯体一样，都是为其灵魂而存在。再次，灵魂也是位移运动的原因，状态变化和数量变化也由于灵魂所致，因为感觉就属于状态变化，而没有灵魂就不可能有感觉；生灭也是，没有营养就不可能有生灭，而没有灵魂就无所谓营养。亚氏虽然没有像柏拉图那样把灵魂看作脱离躯体而独立存在的本体，但灵魂作为生命躯体的形式意义或定义意义上的本体，也就是使生命体成其为某个生命体的原因、本原、本质