色路拉里乌斯拒绝。于是，使节把绝罚色路拉里乌斯的“教皇通谕”放在索菲娅大教堂的圣坛上以示决裂。色路拉里乌斯即刻召开宗.教会议予以反击，宣布罗马教皇及其使节是渎神的人。他们象野猪一样从黑暗的西方来到圣城诬蔑真理，并革除了利奥九世的教籍。至此，教廷东西两派终于正式彻底分裂。
1054年东西两派教会分裂不久，教皇利奥九世去世。1056年神圣罗马帝国皇帝亨利三世去世，年幼的亨利四世即位，其母艾格尼丝摄政。克吕尼派乘机开始了教会摆脱皇权控制的运动，在主教叙任权问题上教权与王权展开了一场较量。
1057年教皇斯蒂芬九世即位（1057—1058在位），支持枢机主教霍姆伯特撰文《反神职买卖三书》，宣称平信徒授任的神职无效。实际是对皇帝有神职叙任权的否定。不料教皇突然去世，引起一场危机。罗马教会的幕后主持者希尔德布兰力挽狂澜，在他的指挥和策划下，召开克吕尼改革派枢机主教会议。选举佛罗伦萨主教格哈德为教皇，称尼古拉二世（1058—1061在位）。为摆脱德皇和罗马贵族的控制，尼古拉二世依照希尔德布兰的策略。与意大利南部的诺曼人结盟，取得意大利北部最强大的封建主的支持。遂与德皇展开