卓的尸体被剁成碎块，焚烧成灰，撒于驰道。董氏宗族子弟被杀一净，葬于乱坟岗。
董卓的诸多亲信故吏被全家抄斩，丧命者多达五千多人。在皇甫嵩、吕布等人的极力劝阻下，王允退了一步，没有把北军数十名军吏的家眷关进大牢，而是暂时监禁了起来。
第二天朝议，王允奏请天子下旨，要求牛辅、李傕、郭汜、王方、贾诩等北军将领立即回京述职，如若迟迟不归，则以谋反论处，诛杀九族。
朝中大臣们很吃惊，纷纷劝阻王允。这道圣旨送过去，牛辅等人自知必死，肯定要叛乱，要带着大军杀进关中。
此刻关中只有吕布的两千兵，皇甫鸿的两千兵，李肃的一千羽林军，即使加上皇甫嵩请来相助的三千羌骑，扶风和冯翊两郡的六千郡国兵，整个关中也不过只有一万四千人，根本不是叛逆的对手。
“大人，我们坚决同意诛杀董卓旧将，但此事必须从长计议，不能操之过急。”司空淳于嘉劝道，
“大人急于重振社稷，安定天下的心情，我们非常理解。但前提是，我们要先稳定关中，要把牛辅等人的军队控制到手，然后才能杀他们。关中无论如何不能再起战火了。”皇甫嵩非常生气，脸色铁青，一言不发。