几年后，郑玄又从兖州东郡张恭祖大师学习《周官》、《礼记》、《左氏春秋》、《韩诗》、《古文尚书》等书，其中除《礼记》和《韩诗》外，均为古文经学的重要典籍。
郑玄向第五元先和张恭祖学习了今、古文经学两大学派的重要经籍后，尚不以此为满足，又从陈球受业，学习了《律令》。
在此期间，他还以明经学、表节操为目的，游学于幽、并、兖、豫各地，遍访名儒，转益多师，共同探讨学术问题。
三十七岁时，郑玄西入关中，通过卢植介绍，师从著名的古文经学家马融。
马融是扶风茂陵人，学识渊博，曾遍注儒家经典，使古文经学达到了成熟的境地。
郑玄投学门下三年不为马融所看重，甚至一直没能见到他的面，只能听其高足弟子们的讲授，但郑玄并未因此而放松学习，仍日夜寻究诵习，毫无怠倦。
有一次，马融和他的一些高足弟子在一起演算浑天（古代一种天文学）问题，遇到了疑难而不能自解。
有人说郑玄精于数学，马融于是把他召去相见。郑玄当场解决了问题，这使得马融惊叹不已。
此后，马融对郑玄十分看重，亲自授学。郑玄在马融门下学了七