所谓土着巴人，指的是土生土长在巴山蜀水之间的族群。
巴蜀文明之渊源，并不逊色于中原文明。随着巴王国和蜀王国的覆灭，许多土着巴人为避难，而躲入了深山老林之中。随之时间的推移，巴蜀日趋平静。有许多巴人走出深山，成为归化巴人。但是，仍有一大批巴人还生活在深山老林里面，以一种非常原始的方式生存。
这批人，也就是土着巴人。
土着巴人的群体非常大，甚至远远过了归化巴人的数量。
巴山蜀水之间，大约生活着数十万土着巴人。这些人不遵循秦法教化，当然也没有任何书面的资料可以进行统计和管理。准确的说，这是一批游离于秦法之外的族群。他们信奉天地，尊奉鬼神。在张仪司马错夺取了巴蜀之后，巴人之乱，使得巴蜀大地近百年不得安宁。
在秦王政登基之初，巴蜀就出现过一次大动荡。
也就是在那一次动荡中，秦清坚定的站在了秦王政的一边，凭借着她的威望，平定了巴蜀。
至于是通过什么手段？
很少有人知晓……在秦清平定了巴蜀之后，归化了十余万巴人，也使得巴蜀两郡，日趋繁华。此后，巴蜀两地相继有了枳县、朐忍、郫县、严道