使宫变者也去了含元殿，待他们发现上了当时，仇士良、鱼弘志、郗志荣等人已经挟持着皇帝躲进了宣政殿的后殿，顶死了防火用的包角铜门，而策动宫变的官僚们却囿于礼节，迟迟不敢用重兵器砸开木门，以致坐失良机，功亏一篑。
当日大明宫内只杀的血流成河，所有参与大朝会的官员，管你有没有参与宫变，只要入了神策军的眼，一概格杀勿论。参与宫变的官员，上至宰相宋申锡、王涯，京兆尹罗立言，御史中丞李孝本，下至省寺部司的青绿卑官们或被当场砍杀，或被捕入狱，饱受酷刑后惨死于狱中。
神策军又带刀闯入中书门下两省，见人便杀，宰相贾餗、舒元舆二人并未参与宫变，大乱后退回两省，惶惶不知所措，被闯进来的神策军士不论青红皂白，也一起砍了。两省属官、书吏二百余人同时被杀。砍杀了朝官后，仇士良又趁机发难，将内诸使司里跟自己不和的宦官也诬为逆党，就地斩杀，又杀了三进三出，死伤过千人。
这一路杀下来，到日暮时分，大明宫内外尸积如山，血流成河，阴风飒飒，活人打着灯笼也不敢出行。因为南衙百司和京兆地方彻底瘫痪，致使长安秩序大坏，城内恶少们蜂起劫掠，手持白刃破门入户，奸淫掳掠，搅的满城不安，烧的半边天