部分“秒五厘米”，讲的是时隔第一幕的十三年之后，经历过种种的远野贵树，在偶然再一次的遇到了明理之后的踌躇与豁然。
其实不论最后分离之后的两位主角，在那一列列车驶过的时候的那种见与不见是多么的释然，列车驶过之后，回过头来无一人的铁路对面是怎么的笑容，从读者的角度来讲，那都是一个悲剧。
相当揪心的一个悲剧。
为了削弱这种很刺激读者的悲剧性，之前的时候宫原静有考虑过，把这个故事倒置过来，即把秒五厘米这一节放在最前面，中间那一节还是讲暗恋的宇航员，最后一节变成樱花抄。
这样把最后那种悲剧性的结局放在最前面，读者就有了心理上的适应，然后把樱花抄那种恋情的美好放在最后，这样类似朝三暮四似的改变其实很有效果，进行了故事结构的调整之后，哪怕分镜一格都不便，其实对整体故事表现出来的感情也是不一样的。
从心理上来讲，秒五厘米这一节放在最后会给读者留下期待，他们当然期待着原本相恋的两个人能够最后重归于好，所以当结局出来之后，读者会很难接受，但是如果把这一节放在最前面，那么最一开始就把结局展示出了，观众后一节的樱花抄的时候，心理上的感受是偏