但是好景不长，战后的条约实在欺压失败者太严酷了，这和平也就维持了二百余年，战争再度开始。这次的战争规模再次扩大，因为一方面正义大联盟建立了，另一方面，鬼眼星人袭击了亚特兰蒂斯的苍穹号，无数野心勃勃的新兴民族在羽翼丰满后欲望大大膨胀，增添了要求重新瓜分总星系声音的新生集团的实力也大大增加。而和平大联盟盟主却恍然不觉，只想尽快毁灭正义大联盟，几方面的战争给了红体可趁之机，迅速崛起并吞并了很多新生小国，作为傀儡大军向两大联盟疯狂进攻。在万般无奈之下，两大联盟才被迫决定联手一起对抗红体。
故而这第二场总星系大战总体而言是智慧生命与红体的正邪决战，这个总高度已经压过了下面因为瓜分殖民地不均以及科技意识形态迥异而造成的相对小的矛盾。最终两大联盟合力，将红体赶回了三不管地带，并且派重兵驻守。红体的危机一过，正义大联盟与和平大联盟这两个都号称代表真理的科技发展观势力的矛盾又提升为主要矛盾，由于双方势力相仿，自来也不敢轻举妄动，况且红体一旁窥测，一旦走错就要满盘皆输。谭觉大体了解了关于虫族的历史，其实虽然虫族和人类的历史都是战争史，只是规模不同，但虫族发动战争的本性在本能里，你死我