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地球上并不是只有地球生物，其实外星人已经融入到了地球人类的生活之中，而星际移民局则专门处理和外星人相关的事务，其中有一个部门称为黑衣人，他们专门处理一些来自于外星人所制造的麻烦。加入黑衣人，你就必须放弃自己的一切，包括身份、亲人等等。纽约警察爱德华兹在一次追捕行动中徒步追赶一名实际身份是外星人的嫌疑犯，因此引起了身为黑衣人的特警K的注意，并邀请爱德华兹加入黑衣人。因为成为黑衣人会付出巨大的代价，爱德华兹在考虑了整整一宿之后答应了K，成为了一名真正的黑衣人，代号为J。可是J没想到自己应对的第一起事件就是最臭名昭著的外星人——虫族的入侵。亚基伦王子在地球被入侵的虫族杀害，而他随身携带的“银河系”——宇宙次原子能源的最好来源也失踪了。如果虫族找到“银河系”，那么会给亚基伦人带来灭顶之灾，为了避免这种事情的发生，亚基伦人发出了最后通牒，如果地球人不能在一个小时内找到“银河系”，他们就会摧毁地球。为了地球的安全，K和J决定挺身而出，最终在二人的努力下消灭了入侵的虫族，找到了“银河系”，拯救地球。
“这个就是《黑衣人1》的剧情。”张