后，他一直从事肾内科临床工作。在临床医疗上，精于动－静脉内瘘手术、腹膜透析植管术、肾脏病理诊断、急进性肾炎的诊断与综合治疗、急性肾衰的综合诊治、个体化透析治疗。
擅长于心肾疾病的临床诊断、治疗，尤其对难治性肾脏疾病、糖尿病肾病、高血压肾病、狼疮性肾炎、慢性肾功能衰竭的一体化治疗等有丰富的临床诊治经验，且精于血液透析和结肠透析。
短短几年，除了在国家级行业核心期刊发表了十余篇论文外，还参与编写了几部重要的专著。2005年更获得省级医疗成果奖两项。
在对S市第一人民医院医患人员的调查中了解到，凌云燕在同行中的口碑很好，他为人低调，处事周全，技术上从不藏私，领导和同事们对他的评价都很不错。
除了感觉他喜欢独来独往，不经常和大家说工作以外的其他事情外，就再没别的什么特殊的地方了。
而对患者，凌云燕除了经常在经济上接济贫困的、危重的病人，还经常或帮助他们向院方说情，缓交或者减免部分医疗费用。
大部分人都表示没有听到过他与谁有什么争执和口角，也没听说过他得罪过什么人。
另外，在调查中还掌握到一个情况，