林毅立即传令，给他们发军装，发装备，发粮发饷等，这些军需当然都来自于这几战的战利品，两仗歼灭了三大股流贼三四万人，所得的战利器供养这几千人短时间内当然绰绰有余，眼下粮饷供给当然没问题，这些账林毅早就算好了。
这四千人曾经都是过天星、不沾泥、灯不亮的精华之所在，现在摇身一变成了林毅军队。
由贼到兵，不只是换换军装，给他们好处让他们感激一下，还必须尽快去除他们身上的匪气，就要靠铁的纪律来约束，因此将这四千人集中灌输纪律之后进行分散，整编到林毅的那八千人马当中，各旗各队各营都有，打乱秩序，再相应的带兵队官灌输纪律，管理他们，无论是谁，触犯军纪，当然也是一视同仁。
四千名俘虏整顿了将近十天，林毅除了听汇报，每天都亲自到各营不定时的走访视察，一直到觉得整体上差不多了，这才放心。
要消化这些五千多人马（包括先前被改编的射塌天和扫地虎的一千多人在内）也不是容易的，对末明末的这些流贼，林毅早就有研究，在心里形成了一套征服他们的方案，必须对症下药，刚柔并济，宽严结合，恩威并施，只有这样才能驾驭他们。
现在林毅的人马已经突破了一万二千