所司代，应听从半仓胜重的裁决。半仓胜重在德川家康授意下，只是将牙医兼安备后兄妹处死，其他人尽皆流放。自此司法权尽被幕府所夺。
以心崇传追查清水寺主持宗彭泽庵的罪责，以此为理由剥夺宗彭泽庵、京都大德寺以及妙心寺之紫衣敕许无效，并制定了有关幕府对僧侣寺院管理的法度规章，让朝廷颜面尽失。
宗彭泽庵怒而抗辩，被流放到出羽国春雨庵。
柳之咏、宗彭泽庵见到以心崇传，透露清水寺之事。以心崇传夜闯二条城，德川家康遂派京都所司代即可查办此事。是夜，女权典侍·中院局、内侍·水无濑、菅内侍·唐桥局、左近卫中将大炊御门赖国、左近卫少将花山院忠长、飞鸟井雅贤、难波宗胜、中御门宗信以及兼安备后兄妹二人皆被擒获。
天皇大怒，传旨将众人尽皆斩首。德川家康却道：天皇已经将司法权交给京都所司代，应听从半仓胜重的裁决。半仓胜重在德川家康授意下，只是将牙医兼安备后兄妹处死，其他人尽皆流放。自此司法权尽被幕府所夺。
以心崇传追查清水寺主持宗彭泽庵的罪责，以此为理由剥夺宗彭泽庵、京都大德寺以及妙心寺之紫衣敕许无效，并制定了有关幕府对僧侣寺院管理的法度规章，让朝廷颜面尽失。