可以想象，当那些第二次冲击的幸存者在得知真相后，会有多愤怒。
事实上，他们也的确非常愤怒。
SEELE的十五名高层，除了在被捕时自杀的那些之外，其他人全部上军事法庭，并且以“反人类罪”的名义判处死刑。与此同时，国联也正式将这部分信息昭告天下，同时开启了对SEELE组织成员的全面抓捕行动————方正早就利用《嗫告篇帜》把名单做好了，从上到下一个不落。
这个世界接下来该如何发展，还是要靠他们自己。
至于方正这边嘛……………
在失去了九架EVA量产机后，伴随着SEELE的高层被逮捕，战自的作战也随即中止。这也算是让其他人都松了口气，毕竟他们可不想在这个地方和国家军队为敌。
但是这并不意味着没有秋后算账。
冬月耕造和赤木律子被逮捕了，他们是人类补完计划的实施者和帮手，国联自然不会放过这些人。NERV的设施被彻底封锁，所有工作人员都被强制解散。因为战自之前曾经在SEELE的蛊惑下对NERV发动袭击的行为，自然也是要付出代价。
于是在继旧东京之后，人畜无害小白兔作为国联的坚强后盾和帮助NERV没有被SEELE