非从一开始就对立。教廷信奉的“圣主十诫”中，也未有一条强调过“唯一主”。故而在第三十八代教皇之前，教皇与信仰自然的巫师们之间，都是井水不犯河水，关系勉强算得上和睦。
但第三十九任教皇却是个狂信徒，他定下了第十一诫，即“唯一主”。并控诉信奉自然的巫师们是邪恶、是异端，是地狱使者在人世的化身。他们的存在并会给世界带来无穷尽的灾难，为了求神垂怜，各国必须驱除这些异教者。教廷在全世界有着压倒性数量的信徒与优势，单论民心所向，他们的权利甚至可以凌驾皇权。教廷的这项做法，在扩大了自己的影响力的同时，无意又一次重创皇权。让那些帝国的皇帝们清楚意识到，即使他们是一国之主，但有些事情仍然得听教廷的。
这场浩大的洗劫运动自然引起了巫师们的报复，这些巫师们阴暗狡猾，知道正面赢不了教廷，便在暗处下手。在第三十九任教皇的晚年，巫师们组织了一场大规模暴动。在这场暴动里，教廷丢失了代代相传的宝物，第三十九任教皇更因此而垮下，不到一年便去世了。
现今的教皇是第四十任，他是第三十九任亲自挑选的弟子，因而在对待巫师的手段上较之前任有过之而无不及。对于巫师的“举发制度”便是他提出的——只要被人