弱圣殿骑士的势力，夺回金苹果的艾吉奥在苹果的指引下，把它藏在了罗马斗兽场下的神殿，等待着五百年后某个人的出现。
艾吉奥稳固了刺客组织在意大利的势力，将整个刺客组织发展壮大。在某次阅读叔叔马里奥的文档时，艾吉奥发现了一封他父亲的来信，提及了一个隐藏在著名刺客阿泰尔出生地马斯亚夫的秘密图书馆。
艾吉奥踏上了前往马斯亚夫的旅途，经过了整整十个月的长途跋涉才最终抵达。但意想不到的是，迎接他的竟然是大批的圣殿骑士。在幻觉中，艾吉奥看到了一名白衣刺客，也就是宣传cg中的那一幕。
成功逃离后，艾吉奥询问了被圣殿骑士劫持的工人，知道原来这些圣殿骑士也在寻找进入图书室的方法。
在马可·波罗的父亲尼克罗·波罗书籍的指引下，艾吉奥不断地搜寻马斯亚夫的钥匙，还在君士坦丁堡卷入了拜占庭王室的内部斗争之中。
这些马斯亚夫的钥匙从造型上来就是一张张散发着金光的圆碟，显然是先行者们科技的产物，这其中也蕴含着阿泰尔的记忆，这些记忆是戴斯蒙之前也没有见到过的。
原来，阿泰尔晚年在马斯亚夫建立了一个图书室，把自己的一生简述给尼克罗·波罗。同时，阿泰尔把