支线任务才能开启。
比如在某个高塔上，玩家会遇到拉手风琴的鸟人，和他对话之后会得到一首诗的信息。根据这首诗的信息，玩家要降落到埋在土里的神祠上，随着时间的推移，等高塔的影子和神祠的位置重叠的时候向着高塔射出一发火箭，神祠才会激活。
还有一些神祠隐藏在迷宫中，这些迷宫的墙壁全都是比山还要高，在林克体力不足的时候根本爬不上去，这时候玩家就真的体会到走迷宫的痛苦了。但是等玩家体力全满之后又可以稍微逃逃课，直接爬到迷宫顶上找一条捷径。
进入神祠之后，玩家必须综合利用自己的各种能力来触发神祠中的种种机关，有时候不仅需要一些智慧，还需要一定的手速。比如有些机关要求玩家必须在某个瞬间跳起用林克时间射中远处的机关，手残玩家必须得尝试很多次才能最终完成。
而四神兽和最终boss战的解谜元素，则是达到了最顶级的难度，玩家必须通过自己在神祠试炼中得来的种种经验和知识才能过关。
在神兽战之前，林克要进入神兽英杰所在的村落，完成主线任务，获得nc的帮助。
在神兽战的第一阶段，林克需要和nc相互配合，靠近神兽之后，一边抵挡神兽的远程攻击，一边