达维亚舰队，由范布隆爵士指挥，一艘一百零四炮的三层炮甲板四桅风帆战列舰旗舰，五艘七十四炮战舰，和十艘二十炮双桅快帆船加上十艘十炮单桅快船组成。
大员舰队，由保罗.杜拉弟纽司指挥，十艘五十炮武装商船以及十艘二十炮双桅快帆船，外加三十艘十炮单桅轻快帆船组成。
这个时候，刘钧惊讶于荷兰人舰队强大之时，也迅速的在调动自己的舰队。
他和郑芝龙商议过后。把舰队分成了四支分舰队。
由刘钧亲自统领的北洋舰队，这支舰队以84炮的四桅双层炮甲板的伏波号为旗舰，另有五十炮的四桅武装商船四艘，八炮三桅炮舰两艘，除了这七艘主力战舰外，北洋舰队还有双炮大青头鸟船十艘，双炮赶缯船十艘，快艇小船三十艘。
郑芝龙和郑芝豹各自指挥东海舰队和南海舰队，这两支舰队都各有五艘三桅炮舰，并各有青头、赶缯十艘。另还有发贡炮舰数艘，福船、沙船、快艇等若干。
长江舰队的主力战舰最少，这支由熊文灿指挥的舰队实际上是一支补给舰队，也是一支预备队。
除了这四支舰队外，在澎湖岛上还有岸炮部队，以及马步士兵。
一场庞大的海战即将开始，