一套都督府卫所官职都将取消。
刘钧甚至还请求取消营兵制里面除总兵和副总兵两个官职外，其余的参将游击将军守备都司千总百总旗总等一套营兵制职官。
“以后全国兵马按镇师协标营连队排班编制，镇设总兵，副总兵、参谋长、教练使、镇抚使、监军使、监军佥事等官。而师设师长副师长等官，协设协长副协长等以此照设。”
都督、指挥使、千户等一套官职是早年的卫所制官职，而后来募兵制后，使用的就是新的总兵副将参将游击将军等一套新的营兵制官职制度。由于大明一直没有废除卫所制，因此营兵制兴趣后，虽用了一套新的官职体系，但本身是没有品级的，每个军官都照例要加一个卫所都督职，以定官阶上下。
现在大明上下整军过后，已经不再是过去的营兵制，而是全新的战兵体系，镇师协标营连队排编制，是从上到下的金字塔结构，而不再是原来相对的扁平结构。而且新的这套编制体系，各级军官层也加强了。
再用原来的那套职务不适合，且有了军衔之后，也不需要都督府卫所职作军阶了。
废除卫所职和营兵职，以后采用新的一套战兵军职和军衔后，上下更清晰明了，不会杂乱无序。