朝廷申请牙贴，这就是牙商的从业经营执照，办理牙贴，需要交纳贴钱。同时，每个牙商，都需要按其经营的业绩，向朝廷交税牙税。
牙商们都有同行的组织牙行，牙商不得串行，牙人不得跨市集、跨品种、跨行业经营。如果是房屋牙人，那就只能经营房屋租赁，如果是牛马牙人，便只能经营牛马交易。
京师的牙行有三百多家，拥有牙贴的牙商更是多达数千。这些牙商的经营种类虽不同，但经营方式却大多相同，一般有三种糊弄，一是专替卖方代理，通常他们还有较大的仓库和栈场，如粮行、渔行等。牙行常利用买卖双方不熟悉市场行情的情况，从中牟取额外利润，如货末脱手，卖主急需钱用时，牙行可放高利贷，当货售出后又不及时付款，以图利息。
二是专为买方代理的牙行，一般与买方订有契约，订明品质、价格、数量、交货日期等，既大量预收货款，以图利息，又靠压级压价、大秤进小秤出等手段获取暴利。
三是代购代销兼营的牙行，一般拥有雄厚的资金，从事代购代销经纪业务，有的还自营购销，获利颇丰。
从市场来看，牙行牙商对于经济发展有很大的促进作用。
晚明之时，牙行管理混乱，导致各种高利盘剥、骑盘