金厦双方大动干戈的消息传至杭州后，周士相即动身前往福州，同时一方面向南都禀报，另一方面派使到金厦双方军中，表达齐王殿下的失望之意。
在准备多日后，海战最先爆发。
海战双方，支持郑袭的水师力量要弱于支持郑经的水师。但因陆师方面郑袭的力量要强于郑经，故处于下风的郑袭部水师十分顽强。双方在平海卫、万安所一带进行着激烈的争夺。海面上，“轰轰”炮声隆隆，白烟弥漫，郑经部的大型战船和郑袭部船只展开激烈的炮战，炮弹不断呼啸着落在海中，腾起一道道乳白色的冲天水柱。双方的小船向对方发起冲击，努力杀向大船，或是以火攻，或是接舷跳帮登上敌船肉搏。
郑军水师统帅是建平侯郑泰，此人不愧是海上老将，灵活利用风向和水流情况，使得己方船队始终处于有利位置。而主持郑袭部水师的将领是后军都督刘国轩，此人也是勇猛善战，结果虽郑袭部水师力量薄弱，但双方从中午激战至天黑，郑泰却始终没能取得胜利。最后，因为刘国轩麾下的战船实力毕竟不如郑泰，在平海卫鏖战三天后，损失了一百多艘战船后，刘国轩被迫率部撤离。
郑泰获胜之后，凯旋而归。结果刚到厦门，就接到兴化府的郑经军令，让他马上将水