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秦琼晚年因青年时期历次作战负伤太多而疾病缠身，常对人说：“少长戎马，所经二百余阵，屡中重创。计吾前后出血亦数斛矣，安得不病乎？”
秦琼最威猛的一战是唐夏虎牢之战，这一战他的表现比关羽在白马斩颜良还要耀眼，可以说是无人能攀比。
当时唐军主力进攻洛阳，王世充困守洛阳，弹尽粮绝。只能向称霸河北的窦建德求援，窦建德自然知道唇亡齿寒的道理，带十万大军渡过大河，杀赴洛阳。
为阻止窦建德军西进，李世民带三千五百玄甲精骑星夜赶赴虎牢，占据天险，以阻挡窦建德大军。
那年五月初二，决战打响，秦琼横枪跃马，从敌军正面一直杀到敌军背面，他手持唐军军旗，又从敌军背面杀到敌军正面，千军万马之中，纵横驰骋，勇不可挡！
敌军心生怯意，阵脚大乱，唐军一鼓作气，赢得了虎牢战役的最后胜利，窦建德被迫接受了充当俘虏的命运。
唐夏虎牢战役，为数不多的唐军消灭窦建德军十余万人，成为历史上围城打援的著名战例。王世充眼见窦建德军的主力已经溃败，洛阳城不会再有援军，走投无路之中，向唐军弃械投降，中原的主要地区落入唐军的掌控，唐王朝的统一大业初告成功。