进入残酷的第二阶段小组赛，瓦伦首回合3：0轻取实力较弱的波尔多，不过11月份和3月份的连续两个客场分别0：3曼联和0：1佛罗伦萨，令他们感受到了欧冠的艰难。不过同期联赛中挺进前6的良好形势让瓦伦随后信心大增，主场2：0回敬紫百合后又4：1大胜波尔多，最后一场只须打平即可基本确定出线情况下0：0战平曼联，以小组第2身份晋级八强。
1/4决赛面对阵容豪华的拉齐奥时，瓦伦西亚本也是不被看好的，那时帕尔马、ac米兰、佛罗伦萨已陆续出局，蓝鹰成为8强中意大利的独苗，联赛当中他们和尤文图斯的冠军之争也已进入生死立判的关键时刻。然而主场作战的瓦伦却打出了最经典的防守反击，开场他们就发动了闪电进攻，准确的传递令拉齐奥顾此失彼。第2分钟安古洛利用阿尔梅达失误发起反击，眼镜蛇伊利耶射门被扑出后安古洛一脚补射破门，1：0；1分钟后，出自巴萨青训的中场球员赫拉德从内德维德脚下断球反击，突破拉齐奥后卫防守后破门，瓦伦西亚瞬间便取得了2：0的领先。几乎被打懵的拉齐奥此后虽由小因扎吉扳回1球，但之后却成为赫拉德的表演时间，他分别在第39和81分钟连下两城4：1锁定胜局，其间瓦伦稳固的防守令拉齐奥难