发现了一具带有杰诺瓦细胞的古代种女性尸体，并将其命名为“杰诺瓦”。沾染上杰诺瓦细胞的人，意志薄弱者将完全受到杰诺瓦意识的控制，细胞本身也能带给人强大的具有毁灭性的力量，但这力量受控于杰诺瓦的意识，为杰诺瓦服务。
原作中的萨菲罗斯，原神罗一级战士（即神罗1st士兵，原来共有三人，萨菲罗斯，杰内西斯，安吉尔，三人都已于前作中逝世，zack亦在后来成为1st）中的最强者，被誉为英雄，包括克劳德等无数战士的偶像。无意中发现了神罗战士均是经魔晄浸泡的人体的秘密，于是对自己的出身开始怀疑。后来，从开始翻阅大量文献记载开始，萨菲罗斯逐渐了解了杰诺瓦的秘密并憎恨人类，进而以杰诺瓦的集合体状态出现。受控于杰诺瓦的意识，以吸尽星球的能源为本能，然后再到另一个星球……sephiroth在拉丁语中意为“神性的流出”，在本作的最后出现，最终被克劳德击败。
神罗集团（shinra）
支配着midgar都市的巨大企业，以抽取星球的能源浓缩为魔晄而不断壮大，并企图以此支配世界。魔晄虽然给都市带来了繁华，但过多地抽取能源最终会令星球枯竭。
原本的剧情大抵上就是如此