前锋的9号球衣，与另外一个西班牙金童劳尔组成锋线搭档，打入30多粒进球，表现抢眼，即使是后来阿内尔卡的天价加盟也无法撼动莫伦特斯的主力位置，并且2000年，莫伦特斯帮助皇家马德里夺得了欧冠冠军。
不过，好日子不长久，2000年，弗洛伦蒂诺成为皇家马德里的新任主席后，莫伦特斯在球队中的地位开始变化。弗洛伦蒂诺高价转入菲戈，直接把莫伦特斯挤上替补席，加上这段时间莫伦特斯陷入进球荒，莫伦特斯进入了职业生涯的低谷。但在2002年年初皇家马德里对阵拉斯帕尔马斯的比赛中，莫伦特斯一人独中五元，宣告了他的强势复苏，并在当年第三次代表皇马夺得欧冠冠军。凭借赛季后半段的出色表现，莫伦特斯入选了西班牙国家队参加了2002韩日世界杯。
但在2002年下半年，为了迎接罗纳尔多的到来，莫伦特斯又一次坐上替补席。
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2003年，皇马做出了抛弃莫伦特斯的决定，莫伦特斯被租借到了法甲的摩纳哥队。在那里莫伦特斯却重新找到进球的感觉，焕发生机，成为球队绝对的核心。在2003/04赛季，莫伦特斯完美地上演了一幕“王子复仇记”的超级剧本，2003/04赛季的欧洲冠军联