，商家军依然能够以不足三万的孤军，对抗十数万清军，坚守了南京达一个月之久，同时还给清军造成了大量的伤亡，确实是十分难得，大多数人可不会管什么党争不党争，谁在真正的抗击清军，谁在空喊口号，不干实事，可以看得一清二楚。
在黄宗羲和张煌言都离开杭州之后，商毅也把精力都投入到备战上来，现在防守计划都己经布置好了，当务之急是将兵力都布置到位，而且前一阶段的战斗减员还要补充，而新军的中下级军官缺口也都要选拔，这些工作都要赶来清军新一轮进攻之前完成。
另外就是武器装配也要跟上，由其是现在枪枝不足的情况下，应该如何分配有限的武器，也是一个让人头痛的问题，还有预备军也要再扩充，商毅也决定，在浙江地区再扩充十个预备旅，争取在今年再扩充十万左右的军队，这样才能够保证商家军扩张之后，兵力不致于再不足了。
不过商家军在南京的努力作战到也并没有白费功夫，尽管清军终于在占领了南京，但自己也蒙受了不小的损失，也需要修整一段时间，因此阿济格也决定，暂时停止了军事行动。以稳固南京的防守为主。这样一来，也给商家军赢得了不少的时间，商毅一面准备，一面等待着湖北那边，李定国的消息。
黄宗