“完全无缺之独立自主”，实际上即承认倭国对潮鲜的控制；
割让辽东半岛、抬湾岛及所有附属各岛屿、澎湖列岛等地给倭国；
赔款倭国军费白银2亿两；
开放莎市、重慶、苏洲、杭洲为通商口岸，倭国政府得派遣领事官在以上各口岸驻扎，倭国轮船得驶入以上各口岸搭客装货；
允许倭国资本家在华夏通商口岸设立各种工厂；
倭国臣民可以在华夏通商口岸城市任便从事各项工艺制造，将各项机器任便装运进口，其产品免征一切杂税，享有在内地设栈存货的便利；
本约批准互换之后，两国将战俘尽数交还，满清政斧不得处分战俘中的降敌分子，立即释放在押的为倭国军队效劳的间谍分子，并一概赦免在战争中为倭国军队服务的汉奸分子，免予追究。
这次《马关条约》是继《南京条约》以来最严重的不平等条约，一经传出，国人无不悲愤痛哭，纷纷大骂满清王朝腐败无能，更是纷纷组团来到廣東请愿，请求复兴军总司令王波挥军攻打倭国本土，把所签订的条约尽皆毁灭。
王波一面安慰前来的请愿团，一面暗中下令复兴军开始动手，先是迅速接管廣西，随后派遣舰队护送陆路部队前往抬湾，驱逐在台