猫捉老鼠的游戏一增持续到5月12日，基地星终于向种源号下达返航的命令。
之所以召回种源号，是因为形势生了巨大的变化。
三月底，从太阳系撤出的亚特兰蒂斯舰队突然一分为二，大约四分之一的战舰运载从地球救出来的被俘人员继续返航，占舰队四分之三的主力则不知去向。
这个情报引起了军方的高度重视，但是由于亚特兰蒂斯人事先采取了一系列的迷惑措施，追踪的战舰未能及时现敌舰的动向，失去了敌军主力的位置，事后虽然展开了大面积的搜索，却没能找到这支失踪舰队的位置。
军方各个舰队立即进入战备状态，第二舰队飞抵太阳系与第一舰队汇合，预防亚特兰蒂斯人狗急跳墙毁掉地球。
侦察舰在敌军消失的位置与太阳系之间往返多次，却未能现敌军的蛛丝马迹。
各国的殖民星在收到这个消息之后，迅进行了针对性的布置，动作最大的要属山姆大大叔，他们高价从共和国还有其它国家购买了一批运输舰，完全放弃了现有的殖民星，冷冻全体国民乘坐运输舰飞向深空。
美方事先没有和任何一个国家交流，但是以中方掌握的情报和美方舰队的航向来看，九成是飞向碟族控制的区域。