西元2018年，人类发明了ai（人工智能）。
西元2021年第一例机器人谋杀案诞生，法院以谋杀罪起诉机器人b166er，决定摧毁b166er及其同类。被放逐的机器人在人类发源地(古巴比伦帝国遗址)落脚，它们为这个国家命名为“01”。人类最终使用了核弹轰炸“01”，但机器人并没有因此被毁灭，“01”大举展开反击，人类节节败退。
西元2027年，为了阻断机器的能量来源（太阳能），人类决定在天空中布满乌云，阻挡了太阳，大地陷入一片黑暗。机器早已对人类的，以蛋白质为基础构造的身体了如指掌，他们利用基因工程，开始人工制造人类，利用人体产生的生物电和热量，来维持机器的生存。
人类从“田野”里出生，然后逐渐长大成“果实”，他们的意识被接入机器设计的母体（matrix），又称矩阵，永久的生活在虚拟的世界里，被机器人所扮演的特工监视着。
幸存下来的人类和从矩阵中“苏醒”的人类，生存在基地“锡安”里，不断地进行着将生活在矩阵中的人类解救出来的工作。人类和机器的战争经历了五代，每一代都是锡安被毁灭。
20xx年，第六代救世主尼奥，被尼