帝的消息后不久，中玉兹的两万新军主力，汇合了小玉兹的一万人马，连同两国的两三万民兵，再加上蒙古四汗国凑起来的三万新军和两万多骑兵，一共十一二万军队，以土尔扈特汗渥巴锡为主将，七旬老将舍楞为副将，号称二十万大军，一路烧杀抢掠的攻入了布哈拉汗国的地盘。而布哈拉方面根本无计可施，只得一面盼着浩罕战场上的主力军团赶快回援，一面兵分两路据守住撒马尔罕和布哈拉城。而两城之外的大片地盘，也就只能任凭北方联军肆意蹂躏了。
渥巴锡已经六十三岁了，此前他多年未曾参与展示，可事实证明人家劳保未老。统率的联军在五月的时候就打到了撒马尔罕城外。
撒马尔罕是中亚最古老的城市之一，追溯历史可以推到公元前五百年。这座城市作为布哈拉汗国最重要的商业重镇，布哈拉人也是完成了要塞化的。强攻猛打显然不是好办法，渥巴锡的做法就是挖壕围城，组织大军将整个撒马尔罕团团围住。
然后两次击败了布哈拉人的救援，特别是第二次，给予了布哈拉人沉重的创伤。光俘虏就抓了上万！
然后时间一直走到次年的开春，撒马尔罕之围整整进行了十个月。撒马尔罕城内粮草耗尽，城外的围城大军却还依旧纹丝不动，最