重新振作的郑军一部，刘国轩又用了一天半的时间终于彻底稳定了思明的局势。
二月二十六日，朱锦率第一批撤台的船队撤离思明，三日后抵达澎湖，随即陈永华上奏全军班师，朱锦批曰“可”，不过朱锦并没有第一时间随大队返回台湾，反而滞留在澎湖，直到二个月后，郑克臧随倒数第三批船队抵达澎湖后才一同返台。
事实上从朱锦撤退伊始，进驻同安城的姚启圣、吴兴祚、万正色等闽省清军便已经得到了消息，然而鉴于金门的郑军水师的实力，清军不敢轻易涉渡，于是眼睁睁的看着郑克臧把思明和金门两岛彻底搬空。
三月七日，琼州的总撤退也开始了，郑省英、陈庆等驱使着闻询溃散后不到五千的郑军攘挟着一万多琼州百姓分十一批撤回东宁，尽管最终带回相当数目的物资，但无论如何装饰都标志着朱锦时代反攻大陆的图谋彻底破灭……
四月二十八日，郑克臧陪同朱锦回到安平，还没来得及回去看降世已经快两个月的两个女儿，就同朱锦一起被董国太召到了北园别院：“若辈不才，莫如勿往；今观此举，徒累桑梓、苦生灵，是何益哉！”
听到董国太如此的怒责，朱锦固然面如死灰，郑克臧自然也不好受，于是轻声的为朱锦辩解着：“祖母，中华板