后，对郑玄很佩服，但他也颇为不平：“康成入吾室，操吾矛，以伐我乎！”意思是说郑玄能从他的文章中找出矛盾，用他自相矛盾的说法来驳倒他的立论。
何休和郑玄两人之间的争论以郑玄的胜出而告终，古文经学的地位因此得到了巩固和提高。
由于郑玄对何休的批驳十分有力，使经师和学者们十分叹服。当时京师人称何休为
“学海”，郑玄为
“经神”，郑玄的声望远超何休，追随郑玄学习的弟子有数千人之多。郑玄以古文经学为生，兼采今文经学之长，混糅今古文家法，融会为一，整百家之不齐而形成了自己独到的经学理论。
他利用自己这套独特的理论。从
“通学”的立场上《春秋》三传作综合研究，最终解决了两派争论的焦点问题，清除了两派之间的门户之见，肯定了古文经学的学术地位，基本上结束了这场长达两百余年的今、古文经学的大争辩。
但问题是，因为受当时情况的限制，这场关系到今、古文经学两派生死存亡的大争论并没有击垮今文经学在官学上的主宰地位，这场声势浩大的第三次大争论的结果也没有以诏书的形式遍告天下州郡的学堂和士人。
所以，今文