南蒙古诸部的兼并战争中失败，被迫西移，至宣化府长城外以西以北地域，并把土默特和鄂尔多斯等部也控制在手。
不过后来黄台吉亲征察哈尔、土默特，大败林丹汗，林丹汗败走青海后病死，林丹汗的儿子被俘降金，连林丹汗的大福晋都被黄台吉收做了五大后妃之一。
黄台吉把察哈编入八旗，在清军此次进攻之前，多尔衮还特别下令，把察哈尔部份移到宣化、大同长城外，并分为两翼四旗，同时规定这八旗在清设置的蒙古六盟四十九旗之外，官不世袭，事不自专，属于清人着力控制的地区。
“宣府、大同北边长城外一带就是察哈尔的特区，从北往南依次为察哈尔正黄旗、察哈尔正红旗、察哈尔镶红旗、察哈尔镶兰旗两翼四旗。”
这片地方虽然看起来不大，但位置却很重要。
因为他处于山西北部的阴山山脉，河北北部的燕山山脉，以及河北山西交界的太行山脉，三大山脉的汇聚之地。
这里是一个天然的通道口，还是个岔道口。自古以来都是联通晋冀以及草原的重要通道，清人把察哈尔部落迁回到这里，还破例没有把这两翼四旗编入蒙古六盟四十九旗内，而是直接控治，已经相当于流官，而不是土官了。